| 2023年08月10日 | 令和4年度 成長分野における即戦力人材輩出に向けたリカレント教育推進事業 | 19,867,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年07月04日 | ポストコロナ時代の医療人材養成拠点形成事業 | 56,250,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年05月31日 | 地域中核・特色ある研究大学の連携による産学官連携・共同研究の施設整備事業 | 510,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月28日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 113,706円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | 地域活性化人材育成事業 | 99,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | (木花)長寿命化促進事業 | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月20日 | 令和4年度感染症流行下における学校教育活動体制整備事業 | 1,481,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月15日 | 学校安全特別対策事業費補助金 | 332,288円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月02日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 109,380円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月02日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 231,766円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | (木花)総合研究棟改修(獣医学系) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | (住吉)管理実験棟等改修 | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | (木花他)災害復旧事業 | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和4事業年度授業料等減免費交付金 | 10,265,200円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月06日 | 令和4年度医療施設運営費等補助金(看護師の特定行為に係る研修機関導入促進支援事業) | 2,474,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2023年02月03日 | 令和4年度学校等における感染症対策等支援事業 | 490,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年01月20日 | 感染症予防事業費等国庫負担(補助)金 | 40,158,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年12月16日 | 情報ネットワーク支線系設備 | 421,613,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年12月15日 | (医病)ライフライン再生(電話交換設備等) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年12月15日 | (清武)ライフライン再生(電話交換設備等) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年11月11日 | 令和4年度人材育成連携拠点形成費等補助金[地域活性化人材育成事業分(審査・評価等経費を除く)] | 100,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年09月20日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 542,917円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年09月01日 | ポストコロナ時代の医療人材養成拠点形成事業 | 77,214,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年08月10日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和4事業年度授業料等減免費交付金 | 241,345,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年06月09日 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「マメ科植物研究を支えるミヤコグサ・ダイズリソースの高度化と利用拡大」 | 24,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年06月09日 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「次世代型メダカバイオリソース整備とその拠点形成」 | 550,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年06月09日 | 国立大学附属幼稚園教育体制支援事業 | 1,264,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月30日 | ウィズコロナ時代の新たな医療に対応できる医療人材養成事業 | 34,700,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月30日 | 学校のICTを活用した授業環境高度化推進事業(宮崎大学) | 912,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月30日 | 宮崎大学 デジタル活用高度専門人材育成事業 | 133,317,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月03日 | 教育支援体制整備事業費交付金(国立大学附属幼稚園緊急環境整備事業) | 500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年02月24日 | 令和3年度臨床研修費等補助金(歯科医師臨床研修事業) | 879,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年02月21日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和3事業年度授業料等減免費交付金 | 2,325,700円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年02月21日 | 学校保健特別対策事業費補助金(学校等における感染症対策等支援) | 3,150,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年02月03日 | 感染症予防事業費等国庫負担(補助)金 | 39,868,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年10月21日 | 宮崎県の地域に根ざした異分野融合研究(感染症・創薬・食の科学分野)の継続・強化を目的とした未来型設備共用の環境整備 | 39,458,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月17日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 3,277,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月12日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和3事業年度授業料等減免費交付金 | 249,039,700円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年05月18日 | GIGAスクールサポーター配置促進事業(宮崎大学) | 284,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月23日 | (木花)総合研究棟改修(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月01日 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「メダカ先導的バイオリソース拠点形成」 | 573,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月01日 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「マメ科植物研究を牽引するミヤコグサ・ダイズリソース -基盤情報の再構築と拡充-」 | 29,428,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月30日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 282,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月10日 | (住吉)実験実習棟(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月10日 | (木花)総合研究棟改修Ⅱ(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月04日 | 教育支援体制整備事業費交付金(国立大学附属幼稚園緊急環境整備事業) | 500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月26日 | 学校保健特別対策事業費補助金(感染症対策等の学校教育活動継続支援事業) | 2,800,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (木花)災害復旧事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | 感染症予防事業費等国庫負担(補助)金 | 37,566,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年02月25日 | (清武)基幹・環境整備(衛生対策等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月18日 | 戦略的共用設備一式 | 142,240,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月17日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 1,875,300円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月09日 | 令和2年度インフルエンザ流行期における新型コロナウイルス感染症疑い患者を受け入れる救急・周産期・小児医療機関体制確保事業補助金 | 26,000,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年02月08日 | (清武)附属病院多用途型トリアージスペース整備事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年12月16日 | 学校保健特別対策事業費補助金(学校再開に伴う感染症対策・学習保障等に係る支援事業) | 3,500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年12月03日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 30,235,100円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月30日 | GIGAスクール構想の加速による学びの保障(宮崎大学) | 34,085,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 6,554,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月08日 | 国立大学法人宮崎大学における大学保有検査機器活用促進事業 | 2,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月03日 | 学校保健特別対策事業費補助金(学校再開に伴う感染症・学習保障等に係る支援事業) | 3,500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月17日 | 大学等における遠隔授業の環境構築の加速による学修機会の確保(宮崎大学) | 18,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月07日 | 学校保健特別対策事業費補助金(感染症対策のためのマスク等購入支援事業) | 370,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月06日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 212,599,800円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年06月05日 | (船塚他)基幹・環境整備(衛生対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年05月22日 | 国立大学病院における新型感染症対策高度医療人材養成事業(宮崎大学) | 35,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (木花)ライフライン再生Ⅱ(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (医病)基幹・環境整備(医療ガス設備等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (住吉)実験実習棟(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (医病)中央診療棟改修(総合周産期母子医療センター) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (木花)総合研究棟改修Ⅱ(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年03月12日 | 校内通信ネットワーク整備 | 13,200,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年03月12日 | 学習者用コンピュータ等整備 | 17,370,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月20日 | (田野)管理棟改修(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月12日 | (木花)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年09月18日 | (清武)図書館等改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年08月16日 | 地(知)の拠点大学による地方創生推進事業 | 24,940,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年07月26日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 9,173,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (木花)図書館改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (木花)総合研究棟改修(農学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (木花)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月01日 | テニュアトラック普及・定着事業 | 2,020,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年03月19日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 38,926円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年03月19日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 10,506円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年03月13日 | (田野他)災害復旧事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月21日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 34,511円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月21日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 55,804円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月15日 | (船塚(附幼))ライフライン再生(空調設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年11月22日 | (清武他)基幹・環境整備(ブロック塀対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年10月25日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 214,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年10月25日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 262,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 10,653,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 地(知)の拠点大学による地方創生推進事業 | 43,200,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月27日 | 宮崎大学・機能強化促進費 | 64,775,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (清武)図書館等改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月01日 | テニュアトラック普及・定着事業 | 2,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月01日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(特色型) | 17,026,525円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年03月16日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 12,848円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年03月16日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 9,988円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年02月09日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 18,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年02月09日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 28,509円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年01月29日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(特色型) | -1,863,006円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年10月16日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 242,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年10月16日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 127,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年10月05日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 12,387,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年07月12日 | 地(知)の拠点大学による地方創生推進事業 | 78,100,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年05月09日 | 宮崎大学・機能強化促進費 | 33,024,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月28日 | 優れた若手研究者の採用拡大(宮崎大学) | 51,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月12日 | (住吉)ライフライン再生(給水設備等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月12日 | (清武)ライフライン再生(電気設備等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月01日 | テニュアトラック普及・定着事業 | 3,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月01日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(特色型) | 18,394,336円 | – | 文部科学省 | – |
| 2016年04月11日 | (医病)基幹・環境整備(排水設備整備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2016年04月11日 | (清武)ライフライン再生(排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |