| 2023年09月29日 | 共同利用・共同研究システム形成事業~学際領域展開ハブ形成プログラム~(多階層ストレス疾患の克服) | 45,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年08月25日 | 次世代のがんプロフェッショナル養成プラン | 77,470,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年07月13日 | 国際化拠点整備事業費補助金(スーパーグローバル大学創成支援事業) | 39,889,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | (湯島)ライフライン再生(昇降機設備等) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | (医病)基幹・環境整備(手術室) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | (湯島)総合研究棟改修(歯学系) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | (医病)A棟改修(画像診断センター) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年04月20日 | (医病)ライフライン再生(昇降機設備等) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月17日 | 医学部等教育・働き方改革支援事業 | 28,794,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月17日 | 医学部等教育・働き方改革支援事業 | 19,714,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和4事業年度授業料等減免費交付金 | 684,600円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | 令和4年度医療施設運営費等補助金(看護師の特定行為に係る指定研修機関運営事業) | 2,115,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2023年01月20日 | 感染症予防事業費等国庫負担(補助)金 | 34,511,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年12月16日 | ウィズコロナにおけるハイフレックス型授業設備の整備・入退館管理システム | 384,359,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年11月01日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(女性リーダー育成型) | 24,500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年08月10日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和4事業年度授業料等減免費交付金 | 20,551,600円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年07月22日 | スーパーグローバル大学創成支援事業 | 45,201,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年04月01日 | 研究大学強化促進事業 | 135,700,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年04月01日 | 「富岳」成果創出加速プログラム「大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明」 | 61,709,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年04月01日 | オープンイノベーション機構の整備事業 | 114,655,125円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月30日 | ウィズコロナ時代の新たな医療に対応できる医療人材養成事業 | 69,181,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月16日 | 令和3年度新型コロナウイルス感染症患者等入院受入医療機関緊急支援事業補助金 | 294,000,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年03月04日 | 令和3年度医療施設運営費等補助金(看護師の特定行為に係る指定研修機関運営事業) | 1,988,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年02月21日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和3事業年度授業料等減免費交付金 | 1,264,300円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年02月10日 | 令和3年度医療施設運営費等補助金(歯科衛生士に対する復職支援・離職防止等推進事業) | 12,002,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年02月03日 | 感染症予防事業費等国庫負担(補助)金 | 33,792,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年01月26日 | With/Postコロナ社会における医療サービスの提供を見据えた未来型医療情報ネットワークの構築 | 127,717,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月17日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 3,077,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月17日 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材(がんプロフェッショナル)」養成プラン | 38,112,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月12日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和3事業年度授業料等減免費交付金 | 21,798,600円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月06日 | スーパーグローバル大学創成支援事業 | 49,918,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年06月29日 | 令和3年度労災疾病臨床研究事業費補助金 | 10,010,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年06月21日 | 感染症制圧の基盤整備-「トータル・ヘルスケア」を実現する持続的経営モデルの確立に向けて- | 100,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年06月10日 | 令和3年度(令和2年度からの繰越分)新型インフルエンザ流行期における発熱外来診療体制確保支援補助金(インフルエンザ流行期に備えた発熱患者の外来診療・検査体制確保事業) | 12,344,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年05月10日 | 世代を超えて地球・人類の「トータル・ヘルスケア」を実現する持続可能なTMDU経営モデルの確立~「知と癒しの匠」の創造による世界屈指のヘルスケアサイエンス拠点の形成~ | 111,850,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月23日 | (医病)ライフライン再生(無停電電源設備等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月01日 | 「富岳」成果創出加速プログラム「大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明」 | 62,615,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月01日 | 科学技術イノベーション創出に向けた大学フェローシップ創設事業 | 17,280,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月01日 | 研究大学強化促進事業 | 166,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月01日 | オープンイノベーション機構の整備事業 | 158,753,250円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月23日 | 令和2年度新型コロナウイルス感染症患者等入院受入医療機関緊急支援事業補助金 | 232,500,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年03月05日 | 科学技術イノベーション創出に向けた大学フェローシップ創設準備事業 | 2,475,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (湯島)基幹・環境整備(衛生対策等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (国府台)基幹・環境整備(安全対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | 感染症予防事業費等国庫負担(補助)金 | 33,905,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年02月18日 | 感染対策用口腔外吸引システム | 72,938,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月17日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 535,800円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月03日 | 研究大学強化促進事業 | 3,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年01月18日 | 令和2年度新型コロナウイルス感染症対応医療機関労災給付上乗せ補償保険加入支援事業補助金 | 1,118,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2020年12月03日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 3,614,300円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年11月20日 | 世代を超えて地球・人類の「トータル・ヘルスケア」を実現する持続可能なTMDU経営モデルの確立~「知と癒しの匠」の創造による世界屈指のヘルスケアサイエンス拠点の形成~ | 223,700,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 6,154,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月08日 | 国立大学法人東京医科歯科大学における大学保有検査機器活用促進事業 | 7,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月01日 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材(がんプロフェッショナル)」養成プラン | 58,698,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年08月13日 | スーパーグローバル大学創成支援事業 | 50,081,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月17日 | 大学等における遠隔授業の環境構築の加速による学修機会の確保(東京医科歯科大学) | 18,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月17日 | 令和2年度先端研究設備整備補助事業(研究活動再開等のための研究設備の遠隔化・自動化による環境整備) | 20,688,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月06日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 19,458,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月01日 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 20,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年05月22日 | 国立大学病院における新型感染症対策高度医療人材養成事業(東京医科歯科大学) | 40,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年05月08日 | 統合先制医歯保健学を推進するビッグデータ活用統合システム | 180,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年05月01日 | 「富岳」成果創出加速プログラム「大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明」 | 62,615,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (国府台)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月01日 | オープンイノベーション機構の整備事業 | 176,392,500円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月01日 | データ関連人材育成プログラム | 40,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月01日 | 研究大学強化促進事業 | 183,300,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月12日 | (医病)機能強化棟 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月12日 | (国府台)基幹・環境整備(バリアフリー対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年11月29日 | スーパーグローバル大学創成支援事業 | 2,266,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年08月05日 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材(がんプロフェッショナル)」養成プラン | 86,869,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年07月26日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 5,096,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年06月19日 | スーパーグローバル大学創成支援事業 | 51,524,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (国府台)基幹・環境整備(バリアフリー対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (医病)機能強化棟 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月01日 | 研究大学強化促進事業 | 190,665,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月01日 | オープンイノベーション機構の整備事業 | 176,392,500円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月01日 | データ関連人材育成プログラム | 58,450,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年10月18日 | オープンイノベーション機構の整備事業 | 176,392,500円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 17,190,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 10,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 8,618,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 13,339,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月07日 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材(がんプロフェッショナル)」養成プラン | 101,818,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年06月25日 | スーパーグローバル大学創成支援事業 | 60,616,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年05月22日 | 博士課程教育リーディングプログラム | 23,510,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月27日 | 東京医科歯科大学・機能強化促進費 | 125,522,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (医・歯病)歯科棟南等改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (湯島)基幹・環境整備(RI施設) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月01日 | データ関連人材育成プログラム | 54,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月01日 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(研究支援人材育成プログラム) | 34,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月01日 | 研究大学強化促進事業 | 228,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年11月22日 | スーパーグローバル大学創成支援 | 4,600,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年10月05日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 10,621,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年09月29日 | データ関連人材育成プログラム | 40,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年09月13日 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材(がんプロフェッショナル)」養成プラン | 131,900,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年07月13日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 21,958,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年07月13日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 14,186,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年07月13日 | 未来医療研究人材養成拠点形成事業 | 33,700,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年07月13日 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 28,296,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年06月27日 | スーパーグローバル大学創成支援 | 92,374,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年05月19日 | 博士課程教育リーディングプログラム | 33,576,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年05月09日 | 東京医科歯科大学・機能強化促進費 | 65,568,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月28日 | 優れた若手研究者の採用拡大(東京医科歯科大学) | 42,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月12日 | (医病)基幹・環境整備(監視・保護設備更新等) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月12日 | (湯島)ライフライン再生(電気設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月12日 | (湯島)ライフライン再生(監視・保護設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月01日 | 研究大学強化促進事業 | 249,800,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月01日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(連携型) | 28,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月01日 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(研究支援人材育成プログラム) | 40,700,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年04月01日 | テニュアトラック普及・定着事業 | 3,000,000円 | – | 文部科学省 | – |