| 2023年09月01日 | 教員研修高度化推進支援事業(「新たな教師の学び」に対応したオンライン研修コンテンツ開発事業) | 4,400,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年05月17日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 4,687,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月28日 | 令和4年度国立大学附属幼稚園体制整備事業 | 150,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月20日 | 令和4年度感染症流行下における学校教育活動体制整備事業 | 3,807,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年03月02日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 1,717,930円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | (旦野原他)災害復旧事業 | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和4事業年度授業料等減免費交付金 | 3,370,900円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月17日 | (挾間)教育実習棟改修(医学系) | 0円 | – | 文部科学省 | – |
| 2023年02月03日 | 令和4年度学校等における感染症対策等支援事業 | 1,030,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年12月21日 | 令和4年度医療施設等運営費補助金(総合的な診療能力を持つ医師養成の推進事業) | 16,400,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年11月10日 | 高等学校等就学支援金交付金 | 72,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年08月10日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和4事業年度授業料等減免費交付金 | 267,047,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年06月09日 | 国立大学附属幼稚園教育体制支援事業 | 1,216,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月30日 | 学校のICTを活用した授業環境高度化推進事業(大分大学) | 1,595,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月30日 | ウィズコロナ時代の新たな医療に対応できる医療人材養成事業 | 34,980,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年03月03日 | 教育支援体制整備事業費交付金(国立大学附属幼稚園緊急環境整備事業) | 500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年02月21日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和3事業年度授業料等減免費交付金 | 5,419,900円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年02月14日 | 令和3年度医療施設運営費等補助金(日露医療協力推進事業) | 3,930,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年02月02日 | 令和3年度医療施設運営費等補助金(女性医療職等の働き方支援事業) | 5,391,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2022年01月26日 | 新型コロナウイルス感染病態解析・創薬開発システム | 117,314,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2022年01月25日 | 令和3年度医療施設運営費等補助金(総合的な診療能力を持つ医師養成の推進事業) | 13,330,000円 | – | 厚生労働省 | – |
| 2021年11月11日 | 学校保健特別対策事業費補助金(感染症対策等の学校教育活動継続支援事業) | 750,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年11月09日 | 高等学校等就学支援金交付金 | 81,600円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年08月12日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和3事業年度授業料等減免費交付金 | 271,046,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年05月18日 | GIGAスクールサポーター配置促進事業(大分大学) | 284,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年04月23日 | (挾間)長寿命化促進事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月10日 | (挾間)ライフライン再生(特高受変電設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月04日 | 教育支援体制整備事業費交付金(国立大学附属幼稚園緊急環境整備事業) | 500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年03月03日 | GIGAスクール構想の拡充(大分大学) | 90,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月26日 | 学校保健特別対策事業費補助金(感染症対策等の学校教育活動継続支援事業) | 6,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (王子新町)校舎改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (王子新町)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (旦野原)講義棟改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月25日 | (旦野原)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月18日 | 新興・再興感染症に対する治療薬開発システム | 93,404,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月18日 | 地域災害レジリエンス強化統合システム | 50,985,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月17日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 8,811,100円 | – | 文部科学省 | – |
| 2021年02月08日 | (挾間)附属病院多用途型トリアージスペース整備事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年12月03日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 48,078,700円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年11月05日 | 高等学校等就学支援金交付金 | 70,800円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月30日 | GIGAスクール構想の加速による学びの保障(大分大学) | 33,685,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月08日 | 国立大学法人大分大学における大学保有検査機器活用促進事業 | 1,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年09月03日 | 学校保健特別対策事業費補助金(学校再開に伴う感染症・学習保障等に係る支援事業) | 7,500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月17日 | 大学等における遠隔授業の環境構築の加速による学修機会の確保(大分大学) | 15,032,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月07日 | 学校保健特別対策事業費補助金(感染症対策のためのマスク等購入支援事業) | 390,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月06日 | 大学等における修学の支援に関する法律による令和2事業年度授業料等減免費交付金 | 239,709,400円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年07月01日 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 19,500,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年06月05日 | (王子新町)基幹・環境整備(衛生対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年05月22日 | 国立大学病院における新型感染症対策高度医療人材養成事業(大分大学) | 35,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (旦野原)講義棟改修 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (旦野原)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年04月16日 | (旦野原)ライフライン再生(消火設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年03月12日 | 学習者用コンピュータ等整備 | 17,190,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年03月12日 | 校内通信ネットワーク整備 | 19,800,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月21日 | SPF動物実験支援システム | 113,240,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月20日 | (旦野原)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2020年02月12日 | (挾間)ライフライン再生(特高受変電設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年11月01日 | 高等学校等就学支援金交付金 | 67,200円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年10月10日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 3,052,666円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年08月16日 | 地(知)の拠点大学による地方創生推進事業 | 24,948,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月26日 | 動物感染実験システム | 88,014,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (挾間他)ライフライン再生(給排水設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月22日 | (挾間)総合研究棟改修(医学系) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年04月01日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(牽引型) | 39,434,472円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月21日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 3,714,566円 | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月06日 | (挾間)実験研究棟改修(動物実験施設) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月01日 | (医病)基幹・環境整備(特別高圧受変電設備等改修) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2019年02月01日 | (挾間)ライフライン再生(特高受変電設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年11月22日 | (錦町他)基幹・環境整備(ブロック塀対策) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年10月25日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 2,153,857円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年10月16日 | 高等学校等就学支援金交付金 | 52,800円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年08月08日 | 地(知)の拠点大学による地方創生推進事業 | 59,200,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月27日 | 大分大学・機能強化促進費 | 58,048,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (医病)基幹・環境整備(特別高圧受変電設備等改修) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (挟間)ライフライン再生(特高受変電設備) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (旦野原)災害復旧事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月12日 | (挾間)実験研究棟改修(動物実験施設) | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年04月01日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(牽引型) | 36,442,936円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年03月16日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 1,380,297円 | – | 文部科学省 | – |
| 2018年03月07日 | (挾間)災害復旧事業 | – | – | 文部科学省 | – |
| 2018年02月09日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 2,003,867円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年10月16日 | 特別支援教育就学奨励費交付金 | 2,411,133円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年09月13日 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(牽引型) | 34,456,180円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年08月03日 | 優れた若手研究者の採用拡大(大分大学) | 28,000,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年07月12日 | 地(知)の拠点大学による地方創生推進事業 | 90,333,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2017年05月09日 | 大分大学・機能強化促進費 | 30,110,000円 | – | 文部科学省 | – |
| 2016年02月04日 | (医病)基幹・環境整備(災害拠点病院対応等) | – | – | 文部科学省 | – |